前言：
藥師佛法脈中一些修行密法，如本尊、佛身相……都在經中開示清 楚。當講述藥師七佛經時，同樣讚嘆佛力幻化無窮，為讓眾生安住而幻化七邊緣化土，同時又幻化七佛，為眾生消業、慈悲眾生，帶眾生走過生死河。
如今修習如幻法，了知要回到空性、菩提，由大悲心為基礎，行幻化出各種身相時，實際上只為眾生需要，如此才能渡眾生（而實際上也無眾生可渡，不可執著此事）。藥師佛法脈中有無數多幻化出如來、佛、菩薩，於各處渡生。實際上，藥師佛經常安住法身、菩提、 空、十方圓明、無量光明、常樂我淨、寂靜涅盤之處。
下面介紹藥師法脈，須以經典為依據的修持法，如此以正道修持，可入圓覺菩提。
壹、藥師本願功德經
藥師琉璃光如來接引眾生回淨土，這部經典是我的啟蒙之師，讀完此經時落淚歡喜多日，其中詳述藥師十二大願、灌頂真言咒、藥師佛因地成佛修持。因果輪迴俱身神識不消失，此段說出眾生依業力輪迴的道理。眾生所關注的延命法妙不可言，此段說出需眾生有條件，方可延命，且延命以外需填福、財，於世間才是有用之人。
經典中救脫菩薩、曼殊師利引導請問修行，仍是以消貪業、慢業為主，藥師佛消各種貪業，由貪引發殺、盜、淫、妄等各種業障。業障淨除，本心離垢清淨，則光明顯現。當然要以藥師佛為師，需要供佛、拜佛、設幡、供燈、供香等妙供，進入密法修持，以持咒供養諸 佛，次第有十五種之多，最後以清淨心、摩尼寶、光、曼達供、無相供養、寶燈等妙供，入大毘廬遮那如來處。
十二大願經常讀誦，不忘失藥師佛願力，最後以十 二句咒語，以咒佈施於法界，轉動藥師佛的法輪。
藥師佛每個願都有法可行，修持藥師佛的弟子， 悲願要擴大，並以戒為師，莊嚴身相……即可入密行。
此藥師佛即為藥師琉璃光如來東方淨土的報身佛。 淨土內有各種願力藥師佛、菩薩、金剛護法（一般書中只提八大菩薩及十二藥叉大將護持藥師琉璃光如來壇城），並有化佛、化菩薩、清淨大海眾菩薩等無數量菩薩於淨土中修持。
一、藥師清淨如來曼荼羅
藥師琉璃光壇城清淨世界，其中如來佛，均為藥師琉璃光如來幻化。菩薩修行亦可修此法，成為○○藥師琉璃光如來、○○如來、○○菩薩，其法脈相同、自性不同。
█藥師清淨如來曼荼羅
‧此中間即為東方世界淨琉璃藥師琉璃光如來報身佛。
█東方淨土世界壇城
二、藥師佛淨土如來秘密曼荼羅
藥師琉璃光如來幻化諸如來、淨土，接納不同根器的菩薩。菩薩仍繼續修行，可成為佛、如來。
三、如來秘密淨土曼荼羅
此壇城世界是如來幻密世界，非文字可述說。壽代表恆常不變，此淨土代表圓滿、清淨、成就、妙用。此為寂淨、常樂我淨!
四、藥師十二大願
第一大願：願我來世，得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明熾然照耀無量無盡無邊世界，以三十二大丈夫相，八十隨形莊嚴其身；令一切有情如我無異。
第二大願：願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹， 淨無瑕穢；光明廣大，功德巍巍，身善安住，燄網莊嚴過於日月；幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業。
第三大願：願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便， 令諸有情皆得無盡所受用物，莫令眾生，有所乏少。
第四大願：願我來世得菩提時，若諸有情行邪道者，悉令 安住菩提道中；苦行聲聞獨覺乘者，皆以大乘而安立。
第五大願：願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於 我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒、具三聚戒；設有毀犯，聞我名已還得清淨，不墮惡趣！
第六大願：願我來世得菩提時，若諸有情，其身下劣， 諸根不具，醜陋、頑愚、盲、聾、瘖、啞、攣躄、背僂、白癩、顛狂、種種病苦；聞我名已，一切皆得端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦。
第七大願：願我來世得菩提時，若諸有情眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦；我之名號一經其耳，眾病悉除，身心安樂，家屬資具悉皆豐足，乃 至證得無上菩提。
第八大願：願我來世得菩提時，若有女人為女百惡之所逼惱，極生厭離，願捨女身；聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提。
第九大願：願我來世得菩提時，令諸有情出魔罥網，解脫一切外道纏縛；若墮種種惡見稠林，皆當引攝置於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無上正等菩提！
第十大願：願我來世得菩提時，若諸有情王法所加，縛錄鞭撻，繫閉牢獄，或當刑戮，及餘無量災難凌辱，悲愁煎逼，身心受苦；若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦！
第十一大願：願我來世得菩提時，若諸有情饑渴所惱， 為求食故造諸惡業；得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食飽足其身，後以法味畢竟安樂而建立之。
第十二大願：願我來世得菩提時，若諸有情貧無衣服， 蚊虻寒熱，晝夜逼惱；若聞我名，專念受持，如其所好即得種種上妙衣服，亦得一切寶莊嚴具，華鬘、塗香， 鼓樂眾伎，隨心所翫，皆令滿足。
貳、藥師七佛經
藥師琉璃光如來接眾生回化土。藥師琉璃光如來幻化七佛，主持七化土的教化工作，因眾生執著某種業成習氣，以致無法到東方淨土中。藥師琉璃光如來只有化七佛土，先安住有緣眾生，待業清除後，再接引回淨土。此七佛土屬淨土的邊緣化土，每一個化土都有如來、佛、菩薩教導眾生。此七如來如下（主願力為消地水火風空及外道邪見之業障）：
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- 吉祥王如來：地大
- 妙行成就如來：水大
- 獅子吼如來：火大
- 天辟雷音如來：風大
- 遊戲神通如來：神通、外道、邪見
- 光音自在如來：空大
- 藥師琉璃光如來：入本心至淨土壇城中修三昧。
每位如來的國土有名號、願力不同，詳文請參考 《藥師七佛經》。每位如來以咒語渡生。當時筆者讚嘆藥師琉璃光如來為眾生巧妙安排，其悲願無法形容，只願 未來能學習佛菩薩心，關心照顧有緣眾生。
修持藥師法，上求佛道下化眾生是雙軌制，可同時進行，這也是菩薩道修持者需知的。那何者是上求佛道，何者為下化眾生？舉例來說，本心離垢、修菩提心、持咒修三觀、修三昧、修波羅蜜是上求佛道，而持咒迴向有緣眾生、佈壇、佈施、接引回淨土……則是下 化眾生。此目的期許修行者福慧資糧俱足，下化眾生是佛菩薩方便法，上求佛道入菩提心，十方圓明則是主修，希望修行者勿偏廢。
藥師佛弟子要修慈悲喜捨四無量心、無怨害心、平等心、柔軟心、清淨心，及各種三昧法，這些都是住本心修持。每一種心及三昧都有咒可持用。
藥師佛願力使修行者能自建淨土、壇城，修行者可以自己有能力渡生，所以藥師佛不厭其煩的幻化各種有專業能力的佛來指導修行者。藥師法脈中有無量多的如來、佛、菩薩（七佛願力請看《藥師七佛經》）。
參、藥師寶懺
此為消災延壽佛的法，於娑婆世界為眾生消業、解冤結。藥師寶懺是消災延壽的法本，寶懺分上、中、下三卷，內容精采無比。寶懺請了大行普賢王菩薩、普賢菩薩及其他諸佛，這些都是執事懺悔的主要佛菩薩，可以消現在、過去的業障。修行者想要有成就，其祕密法就是要做懺悔。
消災延壽藥師佛於娑婆世界中為眾生消業障、解冤結，所有冤結因貪嗔癡三業引發，所以修行由消業障、消罪障、消災障、降魔障、消怨氣……一串串的修行功課，逐步登梯而上。
人世間的結則須由懺悔及發露懺悔、改過行為，使心的慈悲心、包容心擴大，不斷學習、改變自己。
1.經過懺悔消業後，本心光明證菩提，出世間時渡生工作如下。
2.█消災延壽藥師佛以藥草為眾生消六種業障，須以咒語持用。
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- 貪：紅花
- 嗔：當歸
- 痴：黃耆
- 慢：熟地
- 疑：伏苓
- 淫：麥草
█消災延壽藥師佛以藥草為眾生消五蘊身業障。
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- 貪：白藥
- 嗔：山藥
- 痴：熟地
- 慢：生地
- 疑：麥門冬
- 淫：魚腥草
3.消災延壽藥師佛也以藥瓶、甘露、藥壺為眾生修補氣身、解毒、灌入能量、修補精神身。
4.消災延壽藥師佛以蜜水渡小精靈，由此而得人身。
5.消災延壽藥師佛以米、水渡陰界眾生，由此脫離依業輪迴三惡道之苦（電光如來、電光佛則是渡天界眾生）。
消災延壽佛壇城：
1.位於藥師淨土曼荼羅中，參考藥師山通訊44期圖說（第31頁）。以延壽如來為主導，化四如來分別主事佛、蓮、寶、金剛、羯摩部。
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- 延壽如來
- 延智如來
- 延淨如來
- 延光如來
- 延空如來
2.延壽如來背光又可幻化七如來，以消業增智為願。
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- 智壽如來
- 妙壽如來
- 空壽如來
- 藏壽如來
- 光壽如來
- 祕壽如來
- 德壽如來
3.延壽如來又化五佛，消五趣六道眾生的業。
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- 永明延壽藥師佛：小乘、禪宗
- 消災延壽藥師佛：人道
- 廣明延壽藥師佛
- 智藏延壽藥師佛 其他各道
- 祕光延壽藥師佛
永明延壽藥師佛願力以智種子渡生，使眾生有智慧，幻化有延壽菩薩及延祕菩薩。消災延壽藥師佛願力以藥草渡生，使眾生離苦得樂，幻化有消罪障菩薩及增福壽菩薩。所以在傳法時，永明延壽藥師佛持缽、消災延壽藥師佛持藥草（青軻草），二者有所不同。
肆、寶藥如來法
為藥師琉璃光如來幻化以「藥」渡生的如來，此寶藥如來為渡眾生，尤其對病苦、病魔、精神身、淫苦、情苦、貧苦及各界眾生都有妙藥，使之清淨、解苦。
一、寶藥如來壇城以寶藥如來為主，幻化四如來如下，以做佛、蓮、寶、金剛、羯摩部等佛事業
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- 寶藥如來
- 藥王如來
- 藥上如來
- 藥智如來
- 藥光如來
寶藥如來主要教導：
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- 淨土中修藥師佛法脈中以「藥」渡生修行者的教授。
- 教導修行者以密行修二十五手法，具二十四臂，每手都拿法器，以藥壺、藥瓶、藥草、藥仔為主。
- 學習如幻法，經千手千眼觀音如來加持，則幻化成千手千眼寶藥菩薩，或千手千眼寶藥如來，至各道渡生。
- 渡有緣的修行者，淨光明、星宿長老二修行者，修習藥王藥上如來法，最後自己也修有淨土及淨眼如來、淨藏如來，詳文參看《藥王藥上經》。
- 願意以寶藥到各道渡生者。
二、有七菩薩修寶藥如來法，在不同道渡生
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- 藥光菩薩：以光渡生、以光消業，六道眾生無不歡喜。
- 藥智菩薩：渡天界，以藥草開智慧。
- 藥慧菩薩：渡外道、神道，以藥草渡生。
- 藥王菩薩：渡閻浮堤眾生，以訶黎勒雪蓮藥草消業。
- 藥藏菩薩：渡人道眾生，以藥丸渡生消業。
- 藥雲菩薩：渡化土眾生，以藥草渡生消業。
- 藥上菩薩：渡娑婆世界眾生，以妙藥消業。
三、觀藥王藥上二菩薩經
藥王藥上二菩薩因地修持時，名星宿長老及淨光明，二者受日藏比丘教導清靜平等心、發菩提心、行菩薩道、持戒、修行波羅蜜，因地發願時，以訶黎雪山勝藥及其他藥行佈施，眾生經懺悔，受佛力加持，可修補四大、滅諸罪障，由是增加福德力。藥王藥上修本尊， 最後現佛光明身相、光明巍巍，其妙藥為渡生工具，由此修成淨眼淨藏如來，形成淨土。
經文中述出因地修行的心態、願力，發心對佛及比丘的尊敬，都是修行的基礎，這是個心路歷程，無論任何法門都同樣的。
因藥王藥上二菩薩因地時受記為法子，所以有如此成就，同時開示出八十八佛為眾生懺悔消業，直到今日顯教早課中，八十八佛即由此經而出。為現代佛門中基本律儀。
藥王藥上菩薩也能以如幻法幻化各種身以渡眾生。 若依經看，藥王藥上菩薩也是大菩薩。若修行方式與此經相符合，則是正行，若只以神通取眾，忽略心的成長，終不是佛子。畢竟渡生都是方便法，仍要以入空、法身、涅盤住心為要。
□ 藥王菩薩願：
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- 1.願我兩手雨一切藥摩洗眾生、除一切病。
- 2.若有眾生聞我名者、拜我者、觀我身者，皆服甚深妙陀羅尼無礙法藥。
- 3.當今此等現在身上、除去諸惡、無願不從。
- 4.我成佛時，願諸眾生具大乘行。
□ 藥上菩薩願：
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- 1.願我後世得十種清淨力時，以上法藥普施一切。
- 2.願諸眾生聞我名者，煩惱盛火速得消滅。
- 3.若有眾生禮拜我者、稱我名者、觀我身相者，當今此等得服上妙不此解脫甘露上藥。
四、藥草的妙用
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- 1.藥王菩薩以豆類消五毒心：白豆、紅豆、黃豆、花豆、黑豆。
- 2.藥王菩薩以糖增長慈悲心：白糖、紅糖、砂糖、黑糖、冰糖。
- 3.藥上藥王菩薩混合草藥二十三種，消各種業障。
- 4.藥藏菩薩以藥丸消業，以金銀花、車前草為主。
- 5.藥雲菩薩以金銀花、車前草仔消中脈中的情淫二業， 以紅、白、黃、綠、藍、黑、八種色線，求佛力加持持咒可消八種病魔的業障。何謂病魔？執著病理、藥 物……都可算病魔，以下分成八類病魔，病魔精神身都是不健康形態，修行者若遇到病魔，肉身都會生病，常常會病很久，以咳嗽居多：
- 希望別人生病
- 希望自己生病
- 希望給人看病
- 希望看別人病
- 希望看治別人病
- 希望研究別人病理
- 希望研究藥治別人病
- 希望流行病發作
加持者：淨勝藥師琉璃光如來
方法：以青稞草加持色線成藥，即可消業
原因：修法執著或令人生病，此為果報
- 6.藥上藥王菩薩以藥草製成薰香，以此供佛。藥草內含二十一種成分。
五、寶藥如來又幻化度母寶藥佛（又稱度母藥師佛）
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- 寶藥如來
- 度母寶藥佛
- 度母菩薩，以下二十三位度母：
- 綠度母
- 白度母
- 藥王度母
- 如意度母
- 長壽度母
- 寶源度母
- 增福慧度母
- 增權利度母
- 消災難度母：消魔難、消獄難、消毒難、消畜難、消獸難、消病難、消地災、消水災、消火災、消風災、消天災、消兵災。
- 金剛度母
- 降魔度母
□ 白度母：具有七眼，可以觀看更細小生命體，如病毒、細菌，持咒、十二種子字可以收回有毒無毒病毒、細菌、帶殼、寄生蟲，讓眾生得以早日恢復健康。
□ 綠度母：可以使精神身中的氣身、意身、肉身的裡中外三層，共有九法。持咒時，將綠色溶液包住修行者的精神身，形成金剛身。渡病魔時，不易生病。因此綠度母的主願力是修護精神身，更深一層使清淨不染 的種子具有綠液保護，不再染著，此不再染種子可恢復，具有如來藏功能。
南無 寶藥如來
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- 以二十四手修持本尊，叫寶藥佛。
- 以二十四手依千手千眼運作本尊，叫寶藥如來。又名千手千眼寶藥如來。
- 此圖示：
- 1.依左右看，左邊代表修慧、右邊代表修福，屬福慧俱足。
- 2.依上下看，上求佛道、下化眾生，其法不同。
- 3.依整體看，此為本心、菩提，可放無量光，空中妙有，渡生無礙。
- 本尊修持，十八手以渡人天為主；二十四手以渡人天及淨土；千手千眼以渡各道二十五處眾生。
- 本尊持法器：
- 1.若持寶、角金、白銀、元寶……的十八隻手叫多寶菩薩。
- 2.若持藥瓶、藥壺、藥草、藥罐的十八隻手叫寶藥菩薩。
- 3.若持劍、傘、旗、斧、鈴、杵……的十八隻手叫準提菩薩。
寶藥如來二十四臂介紹
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- 1. 日：日輪——日光三昧
- 2. 月：月輪——月光三昧
- 3. 卍：萬字——至德三昧
- 4. 法輪——法輪常轉
- 5. 佛：化佛——可化二十一化佛，化佛本尊成就
- 6. 菩薩：化菩薩——可化十六位菩薩
- 7. 宮殿：代表淨土建立、壇城建立
- 8. 寶蓮：接引眾生
- 9. 寶斧：以寶斧斷情緣
- 10.寶瓶：以寶瓶、甘露，有覺醒、清洗業障
- 11.寶藥：以藥使眾生消業，以白介子可使眾生成佛
- 12.寶壺：以藥修補精神身
- 13.寶印：寶部金庫印，法財聚足，成就佛事業
- 14.寶旗：渡外道邪知見眾生
- 15.寶雲：慈悲覆大眾
- 16.寶牌（令牌）：大日令牌——昭告法界，悉地成就
- 17.鈴：情苦鈴，渡情苦眾生
- 18.筆：法筆、寶筆：弘法利生、法本傳承
- 19/20 寶缽：幻化一切，放光
- 21/22 寶手：雙手合十，住菩提心（護住菩提心）
- 23/24 雙手持長寶，代表福慧俱足、修持大圓滿
- 25.寶珠：形成大玻璃幢，代表本心，本心向右旋，放光加持時，形成化佛無數
- 由此二十五手，以四十種法，即以千手千眼寶藥如來入各道渡生。
- 千手千眼寶藥如來行密冠灌頂。
- 授灌頂後可幻化三寶佛（寶雲三寶佛）及其他寶雲化菩薩在淨土中渡各道眾生。
綠度母、白度母與其他各道菩薩相結合，形成佛母。
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- 尊勝佛母：長壽佛、綠度母、白度母→畜牲道
- 寶勝佛母：寶雲佛、綠度母、白度母→化土
- 至勝佛母：寶雲佛、綠度母、白度母→人界
- 淨勝佛母：寶雲佛、綠度母、白度母→淨土
- 妙勝佛母：寶雲佛、綠度母、白度母→天界
